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水中的生物(主要是微生物)與人體健康關(guān)系密切，影響比較大的王要有細(xì)菌、病毒、致病原生動(dòng)物，此外還有藻類、真菌、寄生蟲、蠕蟲等。

1.細(xì)菌

已發(fā)現(xiàn)飲用水中能引起腸道疾病的有:志賀氏（屬），是細(xì)商性痢疾的病原體；沙門氏菌(屬)，可致沙門氏菌病，它導(dǎo)致全身性較嚴(yán)重的疾患，引起毒血癥，感染肝、脾、膽囊等，還能導(dǎo)致腸壁潰瘍、出血、穿孔等；致病性大腸桿菌，可引起不同癥狀的腹瀉;軍團(tuán)菌，可以使肺部受損，也可出現(xiàn)其他器官如肝、腎、心等受損，引起多種癥狀，死亡率較高;鉤端螺旋體，具有較強(qiáng)的侵襲力，可通過皮膚微小傷口、眼結(jié)膜、鼻和口腔黏膜侵入體內(nèi)，引起黃疸出血、流感傷寒、肺出血等，鉤端螺旋體病爆發(fā)在世界上曾有多次報(bào)道；致病性弧菌(屬)，霍亂弧菌引起的霍亂是一種烈性消化道傳染病，此外還有麥契尼可夫弧菌、河弧菌、副溶血弧菌等均可致病；嗜水氣單胞菌，能產(chǎn)生外毒素、可溶性的血凝素，引起人類O、A、B型血紅細(xì)胞的凝聚，對(duì)人具有潛在的致病性;彎曲菌，以空腸彎曲菌最為常見，可引起輕重不等的腸炎;結(jié)核桿菌，是人和動(dòng)物結(jié)核病的病原菌。

2.病毒

已有100 多種血清型腸道病毒在水體中檢出。其中包括脊髓灰質(zhì)病毒，最常見的一種病毒，嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致脊髓灰質(zhì)炎(小兒麻痹癥)；柯薩奇病毒，可引起胸痛、腦膜炎等疾病；呼腸弧兒病毒(埃可病毒)，可引起胃腸炎、腦膜炎等疾病；非特異性病毒，有的病毒可引起呼吸道疾病和急性出血結(jié)膜炎，有的病毒可引起無菌性腦膜炎和腦炎等；腺病毒，能引起呼吸道疾病、眼部感染、胃腸炎等；甲型肝炎病毒，可引起病毒性肝炎，是一種典型而重要的水傳染病毒疾病。

3. 寄生蟲

可導(dǎo)致人類疾病的典型奇生蟲有：隱孢子蟲，由隱孢子蟲卵囊可引發(fā)隱孢子蟲病，是一種介水消化道傳染病，是胃腸炎的病原體，許多國家的飲用水衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)中將其列為控制指標(biāo)；蘭伯氏賈第鞭毛蟲，進(jìn)人水中的蘭伯氏賈第鞭毛蟲包囊可感染形成甲第鞭毛蟲病，該病是人類 10種主要寄生蟲病之一，臨床癥狀以腹瀉為主；溶組織性阿米巴原蟲，通過飲水途徑，阿米巴能在人體宿主內(nèi)引發(fā)慢性傳染，引起阿米巴痢疾，最終發(fā)展成肝腫大，有時(shí)還能發(fā)展到其他器官。

4. 藻類

藻類污染是水體富營養(yǎng)化的結(jié)果，藻類在水中繁殖令水帶有腥味，使人產(chǎn)生惡心、嘔吐的癥狀。

對(duì)人體健康危害較大的是藍(lán)綠藻。藍(lán)綠藻中的一些藻類能產(chǎn)生微囊藻肝毒素，這是一種劇毒物質(zhì)，對(duì)肝細(xì)胞有破壞作用，并能促進(jìn)肝細(xì)胞癌變，是引起肝癌的危險(xiǎn)因素之一。國外有報(bào)道，飲用有藻毒素污染的水導(dǎo)致家禽、家畜中毒死亡事件；有游冰者因接觸含藻毒素的水而引起皮炎、中毒性肝炎事件；透析病人因透析液中有藻毒素而死亡等。

飲用含有某種病原因子的水，就可能染上相應(yīng)的傳染病。由于病原體的致病能力取決于侵襲性、活力、人的免疫力等，不存在容許濃度下限，人一旦感染，則在人體內(nèi)迅速繁殖，故世界衛(wèi)生組織(WHO）推薦飲用水的微生物指標(biāo)是：腸道病原體以指示菌計(jì)，100mL 水樣中不得檢出埃希氏大腸桿菌或耐熱型大腸桿菌，不得含腸道病毒、病原性原蟲、 寄生蟲、蠕蟲，藍(lán)綠藻毒素的暫定值為 11μg/L。采用指示菌作為衛(wèi)生控制指標(biāo)是因?yàn)橹苯又鹨粶y(cè)定致病因子是困難的。其他的指示菌還有糞大腸菌、類球菌等。